Expertiza e vitală în plină criză provocată de pandemia de coronavirus. Libertatea a deschis o serie de colaborări cu jurnaliștii români de la publicația ZME Science, o platformă independentă de jurnalism de știință.  Semnatarii sunt ziariști cu mare experiență care, în mod obișnuit, relatează pentru publicul pasionat de știință din străinătate. Ei scriu, în fiecare zi, mai multe articole în Libertatea bazate pe cele mai recente date, studii și prognoze despre epidemia de coronavirus. 


Exemplu de structura 3D a unor proteine. Sursa: Wikimedia.
Exemplu de structura 3D a unor proteine. Sursa: Wikimedia.

Compania Americană Nvidia, specializată în producerea de GPU-uri (Graphic Processing Unit – Unitate de Procesare Video) de performanță și circuite integrate pentru industria auto și de telecomunicații, cheamă gamerii să lupte contra Covid-19. 

Folding@home este o aplicație dezvoltată de profesorul Vijay Pande, din cadrul Departamentului de Chimie și Biologie structurală de la Universitatea Stanford, SUA. Aplicația folosește resursele neutilizate ale unei plăci video pentru a simula structura și dinamica proteinelor, în special modul în care acestea se pliază.

Proteinele reprezintă calea de acces prin care virusul poate infecta o celulă.

Proteinele sunt formate din șiruri lungi de aminoacizi și sunt principalul cal de bătaie al sistemelor biologice. 

Dacă ne gândim la ADN-ul nostru ca fiind baza de date ce descrie cum se construiește un corp uman, proteinele sunt roboții și cărămizile care îl construiesc și din care este construit.

Proteinele cară substanțe în și în afara celulelor, sunt folosite ca elemente structurale, și – probabil cel mai important aspect în situația actuală – reprezintă căile de acces chimic prin care un virus poate infectă o celulă. Fiecare celulă umană conține în medie, conform unui studiu din 2003, între 1 și 3 miliarde de proteine.

Procesul de ”protein folding” (‘plierea proteinelor) dictează ce părți ale moleculei sunt expuse pentru interacțiuni chimice. Astfel, funcția unei proteine este dată, în mare parte, de structura ei în trei dimensiuni, nu doar de cea chimică. Dacă înțelegi structura, înțelegi și cum funcționează proteina respectivă.

Dar e mai ușor de zis decât de făcut. Proteinele sunt alcătuite din multe elemente care pot interacționa între ele, și nu multe computere de pe glob sunt suficient de puternice că să studieze aceste plieri.

Ideea din spatele aplicației Folding@home e să distribuie povara calculelor pe cât mai multe computere ”normale”, și apoi să însumeze rezultatele. Aplicația include fiecare computer într-o rețea internațională care folosește puterea de procesare a plăcilor grafice (cea mai perfomantă parte dintr-un computer de gaming) pentru a studia procesul de folding. Poate fi oprită oricând ai nevoie de placa video, și apoi repornit[.

Cum muncesc computerele gamerilor în fața noii epidemii

Deși aplicația nu e nouă – Folding@home a fost pusă pe App Store încă din 2014 – Nvidia face un apel la cei care le folosesc produsele să o downloadeze și să-și pună computerele la muncă în fața noii epidemii.

“După fazele inițiale de asigurare a calității și testare preliminară, echipa Folding@home a difuzat un val inițial de proiecte ce simulează potențiale ținte farmacologice ale [virusului] SARS-CoV-2 [n.r. cel reponsabil pentru Covid-19] și SARS-CoV [n.r. cu care este înrudit, responsabil pentru SARS],” explică Folding@home într-un articol din 10 martie. 

Acest val inițial urmărește să îmbunătățească înțelegerea noastră despre cum coronavirusurile interacționează cu receptorul uman ACE2, necesar intrării acestora în celulele umane.

“Alătură-te nouă și prietenilor noștri de la @OfficialPCMR și  donează-ți puterea de procesare nefolosită a plăcii tale video în lupta contra COVID-19!”, au scris Nvidia pe rețeaua socială Twitter.

Puteți  descărca aplicatia de pe pagina Folding@home pentru sistemele de operare Windows, macOS si Ubuntu, printre altele.

Abonați-vă la ȘTIRILE ZILEI pentru a fi la curent cu cele mai noi informații.
ABONEAZĂ-TE ȘTIRILE ZILEI
Comentează
Abonați-vă la canalul Libertatea de WhatsApp pentru a fi la curent cu ultimele informații
Comentează

Loghează-te în contul tău pentru a adăuga comentarii și a te alătura dialogului.